Počeci Baptističke crkve Zagreb sežu do daleke 1872/73 kad je u Zagreb stigao čovjek po imenu Heinrich Meyer i započeo proučavati Bibliju sa zainteresiranim ljudima u njihovim domovima. No, zajednica dobiva svoj oblik i ustroj nakon 1. svjetskog rata, a Ivan Zrinšćak postaje prvi punovremeni hrvatski baptistički propovjednik u ondašnjoj državi.
1927. godine Vinko Vacek postaje pastorom BC Zagreb a to ostaje sve do svoje prerane smrti 1939. Njegovo svestrano djelovanje doprinosi kvalitativnom i kvantitativnom rastu crkvu, a pokretanjem časopisa „Glas Evanđelja“ usmjerava i obrazuje novu generaciju vjernika. Od 28. travnja 1935. godine BC Zagreb počinje djelovati u Radićevoj 30, gdje se nalazi i danas. U vrijeme komunizma prvi iskoraci u društvo bili su organizacija dolaska Billyja Grahama u Zagreb 1967. organizacija koncerta Cliffa Richarda 1968., osnivanje Teološkog fakulteta «Matija Vlačić Ilirik» zajedno s Evangeličkom crkvom 1976.; širenje izdavačke djelatnosti Duhovne stvarnosti i druge aktivnosti, osobito zahvaljujući dr. Josipu Horaku i dr. Branku Lovrecu. Nakon demokratskih promjena, izbijanja rata, dolaska prognanika i izbjeglica, crkva dobiva novo lice te je veći iskorak u društvo ostvaren humanitarnim radom. Dolaskom Petera MacKenziea za pastora 1993. crkva kreće u smjeru duhovne obnove i nastavlja istom otvorenošću prema društvu. Djelomičnim povratom crkvene imovine prostor u Radićevoj 30 postaje jedna cjelina, a njegovim se uređenjem dobivaju bolji uvjeti za rad s djecom i mladima. U isto vrijeme crkva razvija mnoštvo različitih službi, u koje se uključuje velik broj vjernika, što rezultira i brojčanim rastom članstva. Nakon smrti Petera Mackenzija 2008. godine pastorsku službu preuzima njegov dotadašnji pomoćnik Zdenko Horvat koji vjerno vrši službu osnažujući timski rad, brinući za crkvu i podižući nove suradnike, sve do 2016. godine kad ga Gospodin poziva k sebi. U izazovnom periodu nakon smrti pastora Zdenka privremenu službu pastora preuzima Željko Mraz te vodi i priprema crkvu za sljedeće izbore za pastora 2017. godine na kojima crkva izabire Ivicu Horvata kao trenutnog pastora BC Zagreb te mu 2018. godine pridodaje Filipa Grujića kao pomoćnog pastora. Mnogobrojni vjernici, u nekoliko generacija ugradili su sebe u život i rad ove crkve, a zajednica je Bogu zahvalna za sve njih vjerujući da njihov trud u Gospodinu nije bio uzaludan.
Zahvaljuju:
• za Božju vjernost kroz skoro 150 godina od početaka okupljanja baptističkih vjernika u Zagrebu;
• za godine svjedočanstva i naviještanja Evanđelja u Zagrebu;
• za mnogobrojne vjernike koji su kroz nekoliko generacija ugradili sebe u život i rad zajednice;
• za svu djecu i za obilje mladih ljudi u zajednici koji su uključeni u rad crkve;
• za mlade obitelji i skoro 20 novih beba rođenih u crkvi unazad tri godine;
• za vjernost i ustrajnost starijih članova kao i za podršku koju pružaju radu crkve kroz ohrabrenje, molitvu i konkretnu službu;
• za dobre odnose i suradnju s ostalim evanđeoskim zajednicama na području grada Zagreba;
• za nove osobe koje su izrazile želju za krštenjem;
• za odgovornost vodstva i članova crkve u periodu epidemije;
• za sve uključene u organizaciju i prijenos bogoštovlja u vremenima kada se nisu mogli sastajati uživo;
• za Božje vodstvo i mudrost u ovim izazovnim vremenima.
Pozivaju na molitvu:
• za novu snagu, svježinu i viziju za crkvu i grad;
• za podizanje novih generacija službenika i suradnika;
• za obraćenje članova obitelji, susjeda, prijatelja, kolega, sugrađana;
• za braću i sestre koji se bore s teškim zdravstvenim situacijama, za Božju intervenciju i ozdravljenje;
• za sugrađane pogođene teškim ekonomskim uvjetima uslijed epidemije koronavirusa i sve one koji se već mjesecima bore s različitim posljedicama potresa;
• za završetak epidemije i povratak u blisko zajedništvo bez distance.
